章节 | 内 容 |
一、经典蛋白质组数据的鉴定和质量控制 |
1、鉴定的质谱技术基本原理; 2、蛋白质组鉴定整体分析流程介绍; 3、肽段序列的质谱鉴定(包括序列库搜索、图谱库搜索、De novo); 4、利用鉴定肽段进行蛋白质的推导(组装); 5、肽段和蛋白质鉴定的质量控制; 6、肽段修饰的质谱鉴定和质量控制。 |
二、定量蛋白质组方法和应用 | 1、 蛋白质组有标、无标和肽段SRM绝对定量; 2、 定量结果的显著性分析; 3、 定量软件的介绍及定量方法的应用。 |
三、生物质谱数据库和数据提交及上机实习 | 1、 蛋白质组学实验数据库介绍; 2、 蛋白质组数据共享; 3、 蛋白组质数据提交。 |
四、蛋白质组实验数据介绍及MaxQuant上机实习 | 1、 蛋白质组实验数据介绍; 2、 基于MaxQuant分析一组蛋白质组实验数据。 |
五、蛋白质组学实验设计及蛋白质组信息学常用软件 | 1、利用蛋白质组学实验可以解决的科学问题; 2、蛋白质组学实验设计方案及相应分析策略; 3、蛋白质组信息学常用软件介绍及上机实习。 |
六、修饰蛋白质组学技术原理及应用 | 1、蛋白质翻译后修饰组学的基本概念、原理; 2、蛋白质翻译后修饰组学的方法、工具及注意事项。 |
七、多肽组学技术原理及应用 | 1、多肽组学基本概念; 2、多肽组学实验设计及应用示例。 |
八、质谱数据挖掘和蛋白质基因组学 | 1、搜索数据库的选择和跨物种鉴定; 2、质谱数据挖掘的通用方法; 3、蛋白质基因组学。 |
九、蛋白质组数据注释及功能分析 | 1、蛋白质-基因编号mapping; 2、蛋白质表达数据的聚类分析、相关性分析; 3、富集缺失分析、GO/Pathway 功能注释; 4、染色体定位分析; 5、蛋白质互作网络分析。 |
十、蛋白质组数据分析常用数据库和工具 | 1、常用的生物信息学数据库和工具; 2、蛋白质结构和进化分析主要数据库和工具; 3、上机练习。 |
每人3900元(含报名费、培训费、资料费、上机费等相关费用)食宿统一安排,费用自理。
联系人:张爱国 老师
咨询电话:一八一 ,零一零,八三九九零
上课地点:华南理工大学
时间:10月26——10月29
授课专家:国家蛋白质科学中心(北京 凤凰中心)