思影科技将于2018年3月21日——2018年3月26日(周三-下周一)举办第三届磁共振脑网络数据处理班(详见课表安排)。
1、培训简介
大脑任何区域都不是孤立的,它们之间总产生信息交互。脑网络是描述这种信息交互的主要模型。人脑以网络形式存在和工作,研究脑网络,重点在于描绘大脑网络连接模式,运用多模态数据(结构、功能等)揭示其内在规律,为认知、发育和脑疾病的研究提供新见解。
脑网络的连接模式主要从多模态磁共振脑影像数据中获取,并在基于图论的复杂网络分析框架下加以解析。然而,此过程涉及繁复的图像预处理、众多的网络设置和参数、复杂统计比较等,从而使得很多研究者在开展脑连接组学研究时面临很高的学习成本。
针对这种情况,思影科技的脑网络数据处理课程将从脑功能网络构建分析开始,紧接着着手培训结构网络构建分析,功能和结构并驾齐驱,并辅以脑影像机器学习相关内容。课程囊括了当前主流的脑网络分析方法。在功能上采用神经影像脑连接组分析软件—GRETNA进行手把手教学,在结构网络上采用DTI追踪构建脑网络并加以分析,并引入当前最前沿的基于形态指标共变的脑结构网络分析与格兰杰(GCA)因果分析。希望能够给参与者在磁共振脑网络数据处理上带来帮助与进步。
2、培训对象
参加第三届脑网络数据处理班的学员需要具有一定的功能磁共振或结构影像的基础,希望本次脑网络数据处理班的举办,可以进一步提高参与者的磁共振神经影像数据处理能力。
思影科技一直坚持小班教学的方式,并配备教辅人员,后续提供在线支持,及时解决学员数据处理中存在的问题。
培训内容主要包括:功能磁共振数据基础、功能连接度分析及弥散张量成像基础,网络构建基础及结构、功能网络构建与分析,脑网络构建和分析,GRETNA讲解和上机操作,格兰杰因果(GCA)分析,PANDA讲解及上机操作,基于SurfStat的脑网络统计分析,灰质体积共变网络分析操作,曲面形态指标共变网络分析操作,脑影像机器学习介绍与PRoNTo实战等。
注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(9:00-20:00)或第一天早晨8点30分到达会场,熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。
3、培训课程安排
时间 | 课程名 | 主要内容 | |
第一天 周三 3月21日 刘继欣 |
上午 | 功能磁共振数据基础、功能连接度分析及弥散张量成像基础 | 1.fmri数据集数据结构及物理意义 2.功能连接度物理意义简介 3.种子点相关方法简介及应用 4.节点“关系”的定义(结构、功能) |
下午 | 网络构建基础及结构、功能网络构建与分析 | 1.网络节点的定义(图谱简介、图像分割节点定义) 2.网络连边的定义及意义(功能、结构) 3.网络分析基础 |
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第二天 周四 3月22日 王金辉 |
上午 | 脑网络构建和分析 | GRETNA: 静息态fMRI数据处理 静态网络构建 动态网络构建 |
下午 | GRETNA讲解和上机操作(一) | GRETNA: 网络属性介绍 网络拓扑分析 |
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第三天 周五 3月23日 王金辉 |
上午 | GRETNA讲解和上机操作(二) | GRETNA: 参数统计 置换检验 NBS |
下午 | GRETNA讲解和上机操作(三) | GRETNA: 作图 BrainNet Viewer 作图 |
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第三天 周五 3月23日 |
晚上 18:00- 21:00 |
脑影像机器学习 与实战 |
1.机器学习简介 分类、回归、交叉验证等 MVPA、SVM简介 2.PRoNTo影像模式识别工具包实战 |
第四天 周六 3月24日 吴国榕 |
上午 | 动态有向脑网络构建和分析 | 1. 有向连接分析简介(DCM, GCA等) 2. 双变量/部分条件/多变量Granger Causality分析 |
下午 | DynamicBC和NICE的讲解和上机操作 | 1.基于NICE的血液动力学去卷积和GCA分析操作 2.DynamicBC构建时变有向网络 |
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第五天 周日 3月25日 仲苏玉 |
上午 |
脑白质网络构建和分析 |
PANDA: 1. 弥散磁共振数据的预处理 2. 脑白质网络的构建 3. 脑白质网路构建的上机操作 |
下午 |
脑白质网络拓扑分析及统计分析 |
1. 脑白质网络拓扑分析流程介绍 2. 脑白质网络拓扑分析上机操作 3. 基于SurfStat的脑网络拓扑属性的统计分析 |
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第六天 周一 3月26日 张远超 |
上午 | 基于GAT软件的共变网络分析(一) | 基于GAT软件的灰质体积共变网络分析操作 |
下午 | 基于GAT软件的共变网络分析(二) | 基于GAT软件的曲面形态指标共变网络分析操作 |
4、培训人数
为保证培训质量,此次培训限定人数20人左右,报名敬请从速。
5、培训地点
重庆市渝中区青年路38号重庆国贸中心2004#,具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@163.com,我们会第一时间联系您。
8、缴费方式
银行转账或者支付宝(18580429226,户名:杨晓飞),谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:彭庭烨。电话:023-63084468/15123187262.
10、备注
请各位培训学员自带笔记本电脑(Windows64位系统、i5、4G内存以上、50G剩余存储空间等基本配置;苹果Mac电脑用户如方便请提前使用Bootcamp加装Windows64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;报名请先将回执表发给彭小姐并在3月10日前进行缴费,便于培训安排。