2016上海-基因编辑技术实操班

2016-11-09 15:05来源:医学教育网T大

　　各有关单位：

　　随着分子生物学技术和生物信息学的发展，功能基因组学的研究已成为基因组学中引人注目的新方向和研究热点。利用结构基因组学提供的信息和产物，通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能，使生物学研究从单一基因或蛋白质的研究转向对多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。“智能信息处理技术”为人力资源与社会保障部中国科学院北京分院国家级专业技术人员继续教育基地培训点培训项目，“生物信息”为智能信息处理技术系列培训项目之一。为进一步推动我国生物信息学的发展，提高从业人员的技术水平，北京海淀中科计算技术转移中心（中科院计算所技术转移中心）举办“生物信息学最新技术暨解码基因组功能原理与方法”高级培训班，并由北京嘉诚永恒科技有限公司具体承办，具体事宜通知如下：

　　一、培训目标及特点：

　　培训立足于最新技术和工具，强调融会贯通，强调综合应用。采用“互动式教学、讨论式授课、上机实操”等教学模式。培训邀请的主讲老师均是有理论和实际研究经验的专家。学员通过与专家直接交流，能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路，在研究技术方面领悟更多。

　　二、培训对象：

　　大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。

　　三、时间地点：

　　2016年12月8日——12月11日上海

　　（时间安排：第1天报到，授课3天）

　　四：培训内容：

一、DNA测序技术-原理及技术	a）第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent原理 b）第三代测序技术：PacBio, Hellicos原理 c）第四代测序技术：Oxford NanoPore原理 d）Hybridization based methods e）测序技术的比较及展望
二、基因组编辑技术（CRISPR技术）	1）基因编辑技术发展和CRISPR/Cas9技术基本原理 2）CRISPR技术用于基因敲除、敲入细胞株构建 3）CRISPR技术用于基因敲除、敲入小鼠构建 4）CRISPR技术用于大规模遗传筛选 5）CRISPR技术用于体内基因编辑 6）CRISPR病毒运载系统介绍 7）CRISPR技术应用的其他最新进展
三、生物信息学基本实验技能	a）Linux常用命令 b）EMBOSS，经典序列分析工具集 c）Perl编程基础
四、小RNA（microRNA）研究方法及案例	a）实验流程 b）数据处理比对 c）靶基因富集分析 d ）miRNA-mRNA关联分析 e）主要工具包的使用：miRDeep，mirDeep*
五、长非编码RNA（lncRNA）研究方法及案例	a）实验流程 b）lncRNA的发现和分类 c）功能分类 d）主要工具包的使用：lncRScan，LncRNAFunction等
六表观遗传学研究方法及案例	a ）DNA methylation, MeDIP-seq b ）Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo c ）Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq d ）Chromatin accessibility, DNase-seq e ）3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C
七、基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析	a ）ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq b ）RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq c ）Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d d ）Smart-Seq2 e ）Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq