一、培训特色:
主题明确,针对性强,理论和实践结合,主讲与学员研讨的方式进行;
授课专家拥有丰富的表观遗传学数据分析和项目执行经验;
课下主讲老师为您所遇到的问题提供个性化解答;
配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开;
学员通过与专家直接交流,能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。
二、培训内容:
一、表观遗传学研究现状及未来发展 二、表观遗传学相关的数据库介绍与使用 三、高通量测序技术概述 四、常用生物数据文件类型介绍与格式转换 五、代测序数据质控、比对分析与可视化 六、常用在线工具和数据库使用操作 |
一、DNA甲基化原理、应用及研究方法、微生物基因组 1甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP) 2亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP) 3 高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melting,HRM) 4.比较各项甲基化研究方法存在的优缺点等 二、DNA甲基化数据分析策略 1 WGBS分析:利用fastqc和perl脚本对原始数据进行质控 2 之后用bismark进行mapping和beta值计算 3 R的methylKit包筛选差异甲基化位点并用pheatmap包和ggplot2包进行可视化 4.PeakAnnotator对 这些位点进行功能域和基因注释,最后用DAVID进行GO和 KEGG 通路注释 DNA甲基化调控案例讲解 DNA甲基化测序数据分析上机实战 三、DNA甲基化芯片数据分析上机实战 1芯片DNA甲基化分析 2利用R的IMA包进行差异甲基化位点鉴定并用pheatmap包和ggplot2包进行可 视化, 用DAVID进行GO和KEGG通路注释 |
一、染色质可及性测序技术 二、组蛋白修饰原理与分子功能 三、组蛋白修饰功能 四、核小体定位图谱分析实战练习 五、组蛋白修饰数据分析实战练习一 六、组蛋白修饰数据分析实战练习二 |
一、还原真实染色,质构象--HiC技术 二、TCGA与ICGC,数据库介绍与使用 三、干细胞的表观遗传学研究 四、转录因子ChIP-seq数据分析 五、生存曲线分析 |
非编码RNA研究及数据分析 1. miRNA研究的综合解决方案; 2. miRNA研究的数据分析(芯片、测序); 3. lncRNA研究的综合解决方案; 4. lncRNA研究的数据分析(芯片、测序); 5. Agilent相关技术在非编码RNA研究中的应用。 |
三、报名办法及费用:
每人¥3900元(含报名费、培训费、资料费等相关费用),不含食宿费用,食宿可统一安排,费用自理。
四、联系方式:
联系人:张爱国
联系电话:136 8311 1214
座机:010-58032788
报名邮箱:zky_im@vip.126.com