各企事业单位:
表观遗传学是后基因组时代生命科学研究的前沿。有越来越多的证据表明,由核小体、DNA甲基化、组蛋白修饰构成的表观基因组对癌症、阿尔茨海默症、孤独症和心脏病起到了一定的作用。随着实验技术的进步,产生了海量的表观基因组数据,从这些数据中挖掘生物学特征对理解生命的生理及病理过程有重要意义。面对海量的数据包括DNA甲基化谱、组蛋白修饰谱、核小体定位信息,研究人员开发了针对不同数据的分析工具和策略,理解和掌握表观基因组数据的分析方法,有助于从事表观基因组研究领域的科研工作者深入挖掘疾病、发育和衰老等重要过程的潜在生物标记物,为进一步开展实验和临床应用研究提供潜在靶标。应广大单位和科研院所要求,郑州晟智科信企业管理咨询有限公司特举办“DNA甲基化与表观基因组学数据挖掘与分析”会议。现将有关事宜通知如下:
一、时间地点:
2018年3月29日——4月1日 河南*郑州 (时间安排:第一天报到,授课三天)
二、学习目标:
本次培训将理论和实践有机的相结合,通过对表观遗传学基本理论和基本技术的讲解,使学员们深入了解DNA甲基化、组蛋白修饰、核小体定位的知识以及相关的数据产生的各种高通量实验技术。针对DNA甲基化、组蛋白修饰和核小体定位的数据均配有上机实践,掌握不同DNA甲基化检测技术获取的数据的分析方法和技巧、组蛋白修饰的测序数据峰值探测和差异分析的方法、核小体的全基因组定位的动态分析等。通过此次学习,学员们可以对生命科学和医学上的实际问题开展表观基因组领域的研究。参加此学习后学员将可以上手研究实际问题;
三、主讲专家:
主讲专家来自著名高校及科研机构的高级专家,长期从事从事计算系统生物学及计算表观遗传学领域的教学和科研工作;拥有丰富的科研及工程技术经验,具有资深的技术底蕴和专业背景。
时间 | 授课内容 |
Day1: 表观遗传学概论 |
1.表观遗传学基础知识介绍 2.表观遗传学研究的内容 3.计算表观遗传学研究的内容 4.基因组DNA甲基化水平检测技术 5.计算表观遗传学领域的案例分析 HM450K芯片数据与疾病的案例分析 •TCGA癌症基因组图谱计划的介绍以及数据获取 •DNA甲基化数据的前期处理 •DNA甲基化数据的标准化 •疾病相关的DNA甲基化markers的识别 •markers的应用分析 |
Day2: DNA甲基化测序数据分析与甲基化组综合分析 |
1.DNA甲基化数据资源的介绍(常用数据下载)
2.SRAToolkit安装、使用
3.FastQC数据质量控制
4.Bismark比对回拼、提取甲基化水平
•DNA甲基化测序数据的案例分析
•甲基化数据的可视化及综合效果优化
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Day3:组蛋白修饰与核小体 |
1.组蛋白修饰数据的检测和数据处理
2.组蛋白修饰数据分析工具(峰值探测)
3.核小体定位的工具介绍
•疾病中组蛋白修饰数据案例分析
•发育相关的组蛋白修饰案例分析
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联系人:王辉 13526753778(同微信)