1、基本采用中药饮片为中药配方颗粒的原料，但由于存在所处地域差异，有些品种的中药材来源、中药饮片炮制方法有待统一。

2、基本采用水为提取溶媒，但由于工艺设计理念的差异，设备技术水平的差异，具体提取工艺参数不尽相同，产品收膏率存在差异；个别品种在溶媒的选择上存在争议；经过一段时间的市场考验采用挥发油提取工艺的品种以近合理并能基本统一，约计40种左右。

3、辅料种类及加入比例因受六家试点生产企业在干燥技术水平、制粒工艺水平、市场理念的影响下存在一定差异，需要统一。

4、个别特殊产品，如部分动、矿物药的工艺合理性还有待进步研究。

5、各家质量标准基本按《技术要求》研究设计质量标准项目，但涉及到具体品种标准技术水平、标准限度不完全一致。质量标准的专属性问题尤为突出。

6、包装规格和临床指导折算量受各家产品质量和市场理念认识的不同，差异较大。

7、终端产品主要分为两种形式，单剂量铝塑包装产品和多剂量铝塑袋装产品、瓶装产品，终端调配方式也存在着与之相匹配的两种形式。