违反持有人义务的法律责任主要包括以下几个方面：
1. 行政处罚：根据《药品管理法》和相关法规，对于未履行持有人义务的行为，监管部门可以给予警告、罚款等行政处罚。例如，若持有人未能按规定提交年度报告或在发现药品存在安全隐患时未及时采取措施，将可能受到相应的行政处罚。
2. 刑事责任：如果违法行为情节严重到构成犯罪的程度，则需要承担刑事责任。比如故意隐瞒药品不良反应信息或者提供虚假材料以获取药品注册证书等行为，一旦查实将会被追究刑事责任。
3. 民事赔偿责任：当持有人的违规行为导致患者健康受损或财产损失时，受害者有权要求其承担民事赔偿责任。这包括但不限于医疗费用、误工费以及其他合理的直接和间接经济损失。
4. 市场准入限制：对于严重违反药品管理法规的企业和个人，监管部门还可能采取市场禁入措施，如暂停或撤销其持有的药品注册证、禁止其在一定期限内从事药品生产销售活动等。
总之，作为药品上市许可持有人必须严格遵守相关法律法规的要求，履行好自己的义务，否则将面临上述一系列法律后果。
