抗疟疾药物的作用机制和它们针对的疟原虫生活周期阶段各不相同。大多数常用的抗疟疾药物，如氯喹、青蒿素及其衍生物等，主要是作用于红细胞内的疟原虫，即抑制或杀死已经侵入人体红细胞中的疟原虫。这个阶段是疟疾病症出现的主要原因，也是疟原虫生命周期中最为活跃的繁殖期。
具体来说：
- 氯喹主要在疟原虫处于红内期时发挥效用，能够有效杀灭或抑制疟原虫的新陈代谢。
- 青蒿素类药物则对疟原虫的各个阶段都有一定的效果，但其最显著的作用也是针对红细胞内的疟原虫。
此外，还有一些药物如伯氨喹等可以作用于肝脏中的疟原虫（即红外期），用于预防和根治间日疟。这类药物主要用于防止疟疾复发，因为它们能清除潜伏在肝脏中的休眠形式的疟原虫。
