一些药物能够特异性地结合DNA，从而干扰转录过程。这些药物主要通过几种机制发挥作用：
1. DNA嵌入剂：这类药物如柔红霉素、多柔比星等可以插入到DNA双链之间，导致DNA结构的改变，阻碍RNA聚合酶与DNA模板的正常结合，进而抑制转录。
2. 拓扑异构酶抑制剂：例如喜树碱及其衍生物（比如伊立替康和拓扑替康）能够阻止DNA拓扑异构酶I或II的功能。这些酶在DNA复制、修复以及转录过程中起着关键作用，当其活性受到抑制时，会影响基因的表达。
3. DNA交联剂：如顺铂等重金属化合物可以与DNA形成共价键，造成DNA链间或链内交联，影响DNA的正常功能，包括阻止RNA聚合酶沿DNA移动进行转录。
4. 碱基类似物：例如5-氟尿嘧啶在体内转化为活性代谢产物后可掺入RNA分子中，干扰正常的碱基配对规则，从而抑制转录过程。
这些药物大多用于抗肿瘤治疗，因为它们能够有效阻止癌细胞的生长和分裂。但同时也会对正常细胞产生一定的毒性作用，因此使用时需要严格控制剂量，并密切关注患者的身体反应。
