立体异构（或称为空间异构）是指化合物中原子或基团在空间上的排列方式不同，导致形成的分子具有不同的物理、化学和生物性质。对于药物而言，立体异构体之间可能会存在显著的活性差异，这是因为它们与靶点相互作用的方式不同。具体影响可以从以下几个方面来考虑：
1. 药效学差异：某些情况下，一种立体异构体可能对特定受体或酶具有较高的亲和力，而其他异构体则不具备这种能力或者效果较弱。例如，左旋多巴（L-DOPA）用于治疗帕金森病时有效，而其右旋形式（D-DOPA）没有类似的效果。
2. 药代动力学差异：不同立体异构体在体内吸收、分布、代谢和排泄过程中的行为可能有所不同。例如，某些药物的一个异构体可能更容易被肝脏酶系统代谢掉，从而导致该异构体的半衰期较短；而另一个异构体则可能具有较长的半衰期。
3. 毒性差异：一种立体异构体可能是安全有效的治疗剂，但其另一种形式可能会产生毒副作用。例如，在沙利度胺（Thalidomide）案例中，R-异构体具有抗早孕反应的作用，而S-异构体则导致严重的出生缺陷。
4. 药物相互作用：不同的立体异构体可能与体内其他物质有不同的结合能力，这可能导致它们之间存在差异化的药物相互作用模式。例如，一种异构体可能会增强或减弱另一种药物的效果，而其同分异构兄弟则不具备这种特性。

因此，在药物开发过程中，研究者需要仔细评估不同立体异构体的性质，并选择最合适的候选物进行进一步的研究和临床试验。在某些情况下，可能还需要采取措施来确保生产出的产品主要是特定的有效形式，以提高治疗效果并减少潜在的风险。