在中医理论中，中毒型菌痢（也称为急性细菌性痢疾）的病因主要是外感湿热之邪。具体来说，当人体正气不足时，容易受到外界环境中的湿热病邪侵袭，导致脾胃功能失调，清浊不分，进而出现腹痛、腹泻等症状。此外，中医还认为饮食不洁也是引起此病的重要原因，如食用了被污染的食物或水等，可直接损伤肠胃，引发疾病。
在治疗上，中西医结合的方法不仅重视使用抗生素来对抗细菌感染，同时也采用中药调理患者体质，改善其脾胃功能，促进病情恢复。例如，可以选用具有清热解毒、利湿止泻作用的药物进行对症治疗。
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