西医在诊断手足口病时，主要依据临床表现和实验室检查来进行。首先，医生会根据患者的症状进行初步判断，比如观察是否有发热、口腔内出现疱疹或溃疡、手掌和脚掌以及臀部等部位是否出现了红斑或者小水泡等症状。
进一步的确诊则需要通过实验室检测来完成，常见的方法有：
1. 病毒核酸检测：采集咽拭子、粪便或疱疹液标本进行病毒核酸（如EV71型肠道病毒）的PCR扩增检测，这是目前最为准确的一种诊断方式。
2. 血清学检查：通过检测患者血清中特异性IgM抗体水平来辅助判断是否为手足口病毒感染。但需要注意的是，在疾病早期阶段可能无法检出阳性结果，因此需要在发病后一周左右再次采样复查。
3. 病毒分离培养：将采集到的标本接种于细胞系上进行病毒分离培养，虽然这种方法耗时较长且操作复杂，但对于明确病原体类型具有重要意义。
总之，在临床实践中，医生会结合患者的流行病学史、临床表现以及实验室检查结果综合分析以达到准确诊断的目的。
