抗真菌药物和抗病毒药物是两类不同的药物，它们分别用于治疗由真菌和病毒感染引起的各种疾病。两者在作用机制、适应症以及副作用等方面存在明显的区别。

首先，从病原体的角度来看，真菌是一类具有细胞壁的多细胞或单细胞生物，而病毒则是非细胞结构的微生物，需要寄生在活细胞内才能进行复制。因此，针对这两类不同性质的病原体，抗真菌药和抗病毒药的作用机制也有所不同。

抗真菌药物主要通过干扰真菌细胞膜或者细胞壁合成来发挥其杀菌或抑菌作用。例如，唑类药物可以抑制真菌细胞膜中麦角固醇的合成，导致细胞膜通透性改变，从而使真菌死亡；而多烯类如两性霉素B则能直接与真菌细胞膜上的麦角固醇结合，形成孔道，造成细胞内容物泄露。

相比之下，抗病毒药物的作用机制更加多样。它们可能阻止病毒吸附到宿主细胞表面、抑制病毒核酸复制、干扰病毒蛋白合成或增强机体免疫反应等。比如，核苷类似物如阿昔洛韦能够竞争性地抑制DNA聚合酶活性，阻碍病毒DNA链的延长；而干扰素则是一种广谱抗病毒药物，它能诱导细胞产生多种抗病毒蛋白质，从而抵抗病毒感染。

其次，在临床应用上，抗真菌药主要用于治疗深部组织感染（如肺部、中枢神经系统等）以及皮肤黏膜表面的真菌性疾病。而抗病毒药则广泛应用于流感、艾滋病、乙型肝炎等多种病毒性疾病的预防和治疗中。

最后，在不良反应方面，两种药物也有各自的特点。抗真菌药物可能会引起肝脏损害、肾功能不全及过敏反应等问题；而使用抗病毒药物时，则需注意其可能导致骨髓抑制、神经系统毒性等副作用。

总之，虽然都是用于对抗微生物感染的药物，但抗真菌药和抗病毒药在作用机理、临床用途以及潜在风险等方面存在显著差异。医生会根据患者的具体情况选择合适的治疗方案。