在西医领域，细菌与病毒作为两种不同的微生物，其致病机制存在显著差异。
首先，从结构上看，细菌是单细胞生物，有完整的细胞壁和细胞膜，内部含有DNA和RNA等遗传物质。而病毒则是一种非细胞形态的微生物，由蛋白质外壳包裹着遗传物质（DNA或RNA）组成，没有细胞结构，必须寄生在活细胞内才能进行生命活动。
其次，在致病机制方面：
1. 细菌通过直接侵入人体组织、分泌毒素或者改变宿主细胞功能来引发疾病。细菌感染可以是局部性的也可以是全身性的。例如，葡萄球菌可以通过产生肠毒素引起食物中毒；肺炎链球菌则能破坏肺部的正常防御机制导致肺炎。
2. 病毒主要通过侵入并利用宿主细胞内的资源复制自身，从而干扰或破坏正常的细胞功能，引发免疫反应，造成组织损伤。病毒一旦进入人体，会寻找特定类型的细胞作为其繁殖场所，如流感病毒专门感染呼吸道上皮细胞；HIV则攻击人体的免疫系统中的T淋巴细胞。
总的来说，细菌和病毒致病的主要区别在于：细菌可以独立生存并产生毒素等物质直接对人体造成伤害；而病毒需要依赖宿主细胞才能完成生命周期，并通过改变或破坏宿主细胞的功能来引发疾病。在临床治疗上，针对细菌感染通常采用抗生素治疗，而对于病毒感染，则更多地依靠支持性疗法和抗病毒药物。
