中风后遗症期采用针灸治疗时，穴位的选择会根据患者的具体症状和体质来决定。通常情况下，针灸治疗中风后遗症主要选取的穴位包括以下几个方面：
1. 百会穴：位于头顶正中线上，两耳尖连线的交点处。此穴对于改善意识障碍、头痛等症状有较好的效果。
2. 风池穴：位于颈项部，当枕骨之下，与风府相平，胸锁乳突肌上端凹陷处。针刺此穴可以缓解颈部僵硬、头晕等症状。
3. 曲池穴：在肘横纹外侧端，屈肘时当尺泽与肱骨外上髁连线的中点。对于改善肢体运动功能障碍有良好效果。
4. 合谷穴：位于手背第一、二掌骨之间，近第二掌指关节处。此穴可以用于治疗面部偏瘫等症状。
5. 足三里：在小腿前外侧，当犊鼻下3寸，距胫骨前缘一横指（中指）。对于增强体质、促进恢复有重要作用。
6. 太溪穴：位于内踝与跟腱之间的凹陷处。适用于治疗下肢无力等症状。
7. 三阴交：在小腿内侧，当足内踝尖上3寸，胫骨内侧面后缘。此穴对于调节内分泌、改善血液循环等有良好作用。
8. 环跳穴：位于臀部，股骨大转子最高点与骶管裂孔连线的外1/3与中1/3交点处。适用于治疗下肢运动功能障碍。
根据患者的具体情况，医生可能会适当调整选穴方案，并结合其他治疗方法如中药、康复训练等，以达到最佳治疗效果。针灸治疗应由具有专业资格的中医师进行操作，确保安全有效。
