脑栓塞是指各种栓子随血流进入颅内动脉使血管腔急性闭塞，引起相应供血区脑组织缺血坏死及脑功能障碍。其病因主要分为心源性、非心源性和来源不明性三大类。

心源性是脑栓塞最常见的原因。在心脏疾病中，心房颤动是导致脑栓塞的重要因素。由于心房失去正常的节律，血液在心房内瘀滞，容易形成血栓，当血栓脱落时，就会随血流进入脑血管，造成栓塞。风湿性心脏病二尖瓣狭窄伴心房颤动时，左心房扩大，血流缓慢，也易形成附壁血栓，脱落后可引发脑栓塞。感染性心内膜炎时，心脏瓣膜上的赘生物容易脱落成为栓子，随血液循环到达脑部。心肌梗死时，梗死区域的心内膜容易形成附壁血栓，一旦脱落也可导致脑栓塞。

非心源性病因也较为多样。动脉粥样硬化斑块脱落是常见的非心源性栓子来源。当动脉粥样硬化斑块破裂时，斑块碎片可随血流进入脑血管。脂肪栓塞常见于长骨骨折、脂肪组织严重挫伤等情况，脂肪滴进入血液循环，阻塞脑血管。空气栓塞多发生于胸部手术、潜水减压不当等情况，空气进入血液循环形成气泡，堵塞脑血管。此外，肿瘤细胞、寄生虫及虫卵等也可能成为栓子导致脑栓塞。

还有一部分脑栓塞患者，经过详细检查后，仍无法明确栓子的来源，这部分被归为来源不明性脑栓塞。总之，脑栓塞的病因复杂多样，不同病因导致的脑栓塞在治疗和预防上也有所不同。