肝炎病毒感染导致肝脏细胞损伤的主要机制包括直接细胞毒性作用和免疫介导的损伤。首先，病毒进入人体后会侵入到肝脏中的肝细胞内，在肝细胞中复制并产生新的病毒颗粒。这个过程中，病毒可能会对宿主细胞造成一定的损害，比如消耗大量的能量物质，影响正常的代谢过程，导致细胞功能障碍或死亡。
其次，机体免疫系统在识别出这些被感染的细胞后会启动一系列反应来清除病毒。一方面，特异性T淋巴细胞能够直接杀伤受病毒感染的肝细胞；另一方面，免疫系统的激活还会产生多种炎症因子和抗体，它们通过引发局部炎症反应、形成免疫复合物等方式间接损伤周围健康组织。
此外，长期慢性炎症状态下还可能促进氧化应激水平升高，造成自由基积累，进一步加重了对肝脏细胞膜脂质过氧化的损害。这些因素共同作用下，最终导致肝炎患者出现不同程度的肝功能异常和结构破坏。
