普济消毒饮主治大头瘟之热毒。大头瘟是感受风热疫毒之邪，壅于上焦，攻冲头面所致的一种急性外感热病。
从病因病机来看，风热疫毒之邪从口鼻而入，初起多侵犯肺卫，继而内传，热毒充斥于上焦，上攻头面。头为诸阳之会，热毒循经上攻，气血壅滞，故见头面红肿焮痛，甚则目不能开；风热疫毒蕴结于咽喉，则见咽喉红肿疼痛；邪热郁蒸，故憎寒发热；舌红、苔黄、脉数有力均为里热炽盛之象。
普济消毒饮的组方精妙，针对大头瘟的热毒有很好的治疗作用。方中重用黄连、黄芩清热泻火，祛上焦头面热毒，为君药。牛蒡子、连翘、薄荷、僵蚕辛凉疏散头面风热，为臣药。玄参、马勃、板蓝根有加强清热解毒之功；桔梗、甘草清利咽喉；陈皮理气疏壅，以散邪热郁结，共为佐药。升麻、柴胡疏散风热，并引诸药上达头面，且寓“火郁发之”之意，功兼佐使之用。诸药配伍，共奏清热解毒、疏风散邪之功。
在临床应用中，普济消毒饮主要用于治疗大头瘟，表现为头面红肿焮痛、恶寒发热、舌红苔白兼黄、脉浮数等症状。现代常用于治疗流行性腮腺炎、颜面丹毒、急性扁桃体炎等属于风热疫毒上攻头面者。通过使用普济消毒饮，能够有效清除上焦头面的热毒，疏散风热之邪，缓解大头瘟的相关症状，达到治疗疾病的目的。
