痢疾的治疗需根据其病因、病机和临床特征，遵循以下原则。

首先是辨虚实论治。实证痢疾多由湿热、疫毒、寒湿等邪气侵袭所致，治疗以祛邪为主。对于湿热痢，应清热化湿解毒，调气行血导滞。因为湿热之邪蕴结肠道，气血壅滞，所以既要清除湿热之邪，又要调理气机、行散瘀血，常用芍药汤加减。疫毒痢病情凶险，以清热解毒、凉血止痢为要，可选用白头翁汤合芍药汤，迅速控制病情，防止内陷厥阴等变证。寒湿痢则需温中燥湿、调气和血，用不换金正气散加减，以温化寒湿之邪，恢复肠道气血运行。

虚证痢疾多因久病体虚、脾胃虚寒或阴虚内热等导致，治疗以扶正为主。虚寒痢治当温补脾肾、收涩固脱，可选用桃花汤合真人养脏汤，通过温补脾肾阳气，固涩肠道，缓解久痢不止的症状。阴虚痢则要养阴和营、清肠化湿，用驻车丸加减，滋养阴液的同时清除肠道余邪。

其次，要重视调气和血。痢疾的基本病机是气血壅滞，肠络受损，所以调气和血贯穿治疗始终。调气可使后重自除，行血能令便脓自愈。在用药上，常选用木香、槟榔等理气之品，当归、赤芍等活血之药。

此外，初痢不可骤用补涩，以免闭门留寇；久痢则不宜过于通利，以防耗伤正气。同时，还需注意饮食宜忌，避免食用生冷、油腻、辛辣等刺激性食物，以促进病情恢复。在治疗过程中，要密切观察病情变化，及时调整治疗方案。