痛经的基本病机主要与冲任二脉以及胞宫的周期性生理变化密切相关，可概括为“不通则痛”和“不荣则痛”。
在“不通则痛”方面，多种因素可导致气血运行不畅，使冲任、胞宫气血阻滞。情志因素是常见原因之一，若女性长期处于抑郁、焦虑、愤怒等不良情绪中，会使肝气郁结，气机不畅。气为血之帅，气滞则血瘀，瘀血阻滞于冲任、胞宫，导致经血流通受阻，“不通则痛”，从而引发痛经。寒邪入侵也是重要因素，外感寒邪或过食生冷，寒邪客于冲任、胞宫，血得寒则凝，寒凝血瘀，阻碍气血运行，引起痛经。此外，湿热之邪也可导致气血不畅，湿热蕴结于冲任、胞宫，气血运行受阻，也会出现痛经症状。
“不荣则痛”主要是由于冲任、胞宫失于濡养所致。素体虚弱，或大病久病之后，气血不足，冲任、胞宫失于气血的充养，在经期或经后，气血更显亏虚，胞宫、冲任失于濡养而作痛。另外，肝肾亏虚也会导致这种情况，肝藏血，肾藏精，肝肾不足，冲任、胞宫失于精血的滋养，也会出现不荣则痛的痛经表现。
总之，痛经的基本病机无论是“不通则痛”还是“不荣则痛”，都与冲任、胞宫在经期的气血变化有关，且常与情志、体质、生活环境等多种因素相互影响。
