原发性肝癌常用的诊断检查方法有多种，这些检查对于肝癌的早期发现、准确诊断以及后续治疗方案的制定都至关重要。

首先是血清学检查，其中甲胎蛋白（AFP）是诊断肝癌的重要肿瘤标志物。在排除妊娠、生殖腺胚胎瘤等情况后，若AFP大于400μg/L持续4周，或AFP由低浓度逐渐升高不降，或AFP在200μg/L以上的中等水平持续8周，结合影像学检查有肝占位性病变，可诊断为肝癌。异常凝血酶原（PIVKA - Ⅱ）、α - L - 岩藻糖苷酶（AFU）等指标也有助于肝癌的辅助诊断。

影像学检查方面，超声检查是一种常用的筛查方法，它可以显示肝脏内的占位性病变，了解其大小、位置、数量等情况，还能观察门静脉、肝静脉和下腔静脉内有无癌栓。CT检查尤其是增强CT，能更清晰地显示肝脏的形态、结构以及肿瘤的特征，如肿瘤的强化方式等，对于肝癌的诊断和鉴别诊断有重要价值。MRI对软组织的分辨能力较强，在肝癌的诊断中也具有独特的优势，能够发现一些CT难以发现的微小病灶。肝动脉造影是一种有创检查，通过向肝动脉内注入造影剂，可显示肝脏的血管情况和肿瘤的血供，对于判断肿瘤的可切除性有一定帮助。

此外，肝穿刺活检是诊断肝癌的“金标准”，在超声或CT引导下，用细针穿刺肝脏占位性病变，获取组织进行病理检查，能够明确肿瘤的性质，但这是一种有创检查，存在一定的出血、肿瘤种植转移等风险，一般在其他检查不能明确诊断时才考虑使用。