中医理论体系开始形成于春秋战国至两汉时期。

春秋战国时期，社会处于大变革阶段，学术思想十分活跃，形成了“诸子蜂起，百家争鸣”的繁荣景象。这一时期的哲学思想，如阴阳学说、五行学说等，为中医理论体系的构建提供了重要的思维方法和理论基础。阴阳学说认为自然界的一切事物和现象都存在着相互对立又相互依存的阴阳两个方面，五行学说则以木、火、土、金、水五种物质的特性及其相生相克规律来认识、解释自然和人体生理病理现象。这些哲学思想渗透到医学领域，使中医开始从整体观念出发，认识人体的生理、病理以及疾病的防治。

同时，这一时期的医学实践经验不断积累。众多医家在长期的医疗活动中，对疾病的认识和治疗方法有了更深入的总结。他们通过观察人体的生理病理现象、药物的疗效等，逐渐形成了一些初步的医学理论和治疗原则。

到了两汉时期，中医理论体系得到了进一步的完善和系统化。《黄帝内经》的问世是中医理论体系形成的标志。它全面总结了秦汉以前的医学成就，系统阐述了人体生理、病理、诊断、治疗以及养生等方面的内容，构建了中医理论的基本框架。《难经》则对《黄帝内经》的某些理论进行了补充和发挥，以问答的形式探讨了医学中的一些疑难问题。《伤寒杂病论》更是创造性地提出了辨证论治的原则，为中医临床诊疗提供了规范和方法，使中医理论与临床实践紧密结合起来。

综上所述，春秋战国至两汉时期，在哲学思想的影响、医学实践经验的积累以及医学著作的总结整理等多方面因素的共同作用下，中医理论体系开始形成并逐步走向成熟。