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阿托品在临床上有广泛的用途。
1.解除平滑肌痉挛 适用于各种内脏胶痛，如胃肠绞痛及膀胱刺激症状如尿频、尿急等，疗效较好。对胆绞痛及肾绞痛的疗效较差。用阿托品治疗遗尿症。
2.制止腺体分泌 用于全身麻醉前给药，以减少呼吸道分泌。用于严重盗汗和流涎症。
3.眼科
（1）虹膜睫状体炎
（2）检查眼底 扩瞳作用可维持1～2周，调节麻痹也可维持2～3天，视力恢复较慢。
（3）验光配眼镜 儿童的睫状肌调节机能较强，须发挥充分阿托品的调节麻痹作用。
4.缓慢型心律失常 临床上常用阿托品治疗迷走神经过度兴奋所致窦房阻滞、房室阻滞等缓慢型心律失常，还可用于治疗继发于窦房结功能低下而出现的室性异位节律。
5.抗休克 对感染性休克和出血性休克，可用大剂量阿托品治疗，可能解除血管痉挛，舒张外周血管，改善微循环。对于休克伴有心率过速或高烧者，不用阿托品。
6.解救有机磷酸酯类中毒和有些毒蕈类的中毒。
