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子宫腺肌病病因至今不明。目前的共识是因为子宫缺乏粘膜下层，因此子宫内膜的基底层细胞增生、侵袭到子宫肌层，并伴以周围的肌层细胞代偿性肥大增生而形成了病变。而引起内膜基底层细胞增生侵袭的因素现有四种理论：
①与遗传有关；
②子宫损伤，如刮宫和剖宫产均会增加子宫腺肌病的发生；
③高雌激素血症和高泌乳素血症；
④病毒感染；
⑤生殖道梗阻，使月经时宫腔压力增大，导致子宫内膜异位到子宫的肌层。
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