对输卵管妊娠的治疗，历来主要方法是手术，近10余年来由于高敏感度放免测定β-hCG及高分辨B超和腹腔镜的开展，异位妊娠早期诊断率显著提高，因此临床上一般采用保守手术及药物治疗。
1.手术疗法
（1）输卵管切除术 无论是流产型或破裂型输卵管妊娠，输卵管切除可及时止血，挽救生命，在已有子女不再准备生育的妇女，可同时行对侧输卵管结扎。在需要保留生育能力的妇女，如果输卵管病灶太大，破口太长，损及输卵管系膜及血管，和（或）生命指征处于严重状态时亦应作输卵管切除。在行保守性手术中，输卵管出血，无法控制应当立即切除输卵管。
（2）保守性手术 原则上是去除输卵管妊娠物，尽可能保留输卵管的解剖与功能，为日后宫内妊娠创造条件。年轻女，,本次输卵管妊娠为首次妊娠；无子女已经切除一侧输卵管。应做输卵管切开清除胚胎术。
上述各种手术的术式均可采用腹腔镜和开腹手术两种方式，开腹手术较为直观，可在直视下进行上述操作，而腹腔镜则创伤较小，但需要相关设备和操作人员的熟练技术。
2.药物治疗
甲氨蝶呤主要是用于输卵管妊娠未破裂型，输卵管浆膜完整，无活动性出血，输卵管妊娠产物处直径<3～4cm，腹腔中血液<100ml，β-hCG<3000mIU/ml，生命体征稳定、年轻、要求生育者。用药方法：①MTX口服，临床很少应用；②MTX肌内注射；③MTX-CF方案，甲酰四氢叶酸（CF），CF可逆转MTX毒性不良反应，为目前最常用方法；④MTX局部注射，在超声波引导下用MTX注入孕囊；或腹腔镜直接注视下输卵管内注射。药物疗法过程中必须严密观察腹痛，生命体征，及药物毒性不良反应。并用β-hCG及B超监测输卵管局部情况。
