六气有主气和客气之分，它对人体疾病的影响也各不相同：
1.主气与发病
主气为一年季节性气候变化的主时之气。在正常情况下，为天之六气，对生物及人本无害而有益。在反常情况下，谓之六淫邪气，是破坏自然气候环境，导致人体发病的重要因素。故曰：“至而至者和。至而不至，来气不及也；未至而至，来气有余也，（《素问·六微旨大论》）。
六气时至而至者谓和平之气，即正常的主时之气。时至而气不至者为该来之气不及，时未至而气至者为该来之气太过，均属于六气的失常。六气失常，如果人体能够适应，就为顺而不病。否则，超过了人体的适应能力，就为逆而生病。故曰：“应则顺，否则逆，逆则变生，变则病”（《素问·六微旨大论》）。“当期为应，愆时为否，天地之气生化不息，无止碍也。不应有而有，是造化之气失常，失常则气变，变常则气血纷挠而为病也。天地变而失常，则万物皆病”（《素问·六微旨大论》王冰注）。
六淫的性质和致病特点各异，其发病的病变表现亦有不同的特征。
2.客气与发病
六气司天在泉与发病：客气有司天在泉的不同，对人体发病的影响也不一样。对于司天在泉胜气发病，主要是从值年司天在泉上下二气的不同，找出一般的发病规律。推测时，根据该年年支查表，便可知何气司天，何气在泉。司天之气主管上半年，在泉之气主管下半年。何气司天在泉就是何气淫胜发病。三阴三阳司天，六气下临，而人之脏气上应，由于三阴三阳司天在泉不同，自然界六气变化各异，因此引起人体不同的脏器发病。其中也贯穿着五行生克的理论。现将司天在泉之气与人体发病的关系分述如下：子午之年：为少阴之气司天。少阴君火司上半年之令，热气偏胜，火行其政。因其制己所胜，火旺克金，故以其所胜的肺金病变为主。但是，由于侮反受邪，所以，可见到心本脏的病变，甚至可以影响到生我之脏的肝木，出现胸中烦热，咽干，右胁满，皮肤疼痛，寒热，咳喘，唾血、下血、鼽衄，喷嚏，呕吐，小便变色，甚至疮疡，跗肿，肩背、臂、缺盆等皆痛，心痛，肺部胀满，腹部臌胀而咳喘。其下半年，为阳明在泉之气偏胜，燥淫所胜。由于制其所胜，故以其所胜的肝病为主。但由于侮反受邪及侮所不胜，也可引起肺本脏和心脏发病，出现呕吐苦味、善太息、皮肤面部干枯不泽、足外反热等。
丑未之年：为太阴之气司天。太阴湿土之气主上半年之令。因其制己所胜，故以其所胜的肾水病变为主。但由于侮反受邪，所以还可以见到脾本脏病变，甚至影响到生我之脏的心火，出现跗肿，骨痛阴痹，腰脊头项痛，眩晕，大便难，阴气不用，饥不欲食，咳唾带血，心如悬等。其下半年，为太阳在泉之气所主，寒气偏胜。寒淫于下，肾膀胱自伤，且水旺克火，故还可现心与小肠等脏器的病变，出现少腹疾病，控引睾丸腰脊，上冲心痛，见血，嗌痛颔肿等。
寅申之年：为少阳之气司天。少阳相火之气主上半年之令，火气偏胜，湿热流行。相火淫胜，金受其制，客热内燔，水不能制，故现头痛，发热恶寒而疟，皮肤疼痛，其色黄赤，面身浮肿，腹满仰息，泄泻暴注，赤白痢疾，咳嗽，吐血，烦心，胸中热，鼻衄等。其下半年，为厥阴在泉之气所主。风淫于地，木气有余，脾土受伤，故春病除现心痛支满、两胁里急等肝胆本脏证候外，还可现洒洒振寒，善呻数欠，饮食不下，鬲咽不通，食后呕吐，腹胀噫气，大便疏利或矢气则快然如衰等：卯酉之年：为阳明之气司天。阳明燥金之气主上半年之令。燥金淫胜，木受其克，故春病在肝胆和肺等，表现为左胁痛，疟，肠鸣注泄鹜溏，心胁暴痛，不可反侧，嗌干面尘，腰痛，男子癫疝，女子少腹痛，眼目昏昧不明，眼角疼痛，疮疡痈疽以及咳嗽痛等。其下半年，为少阴君火之气在泉。热气偏胜，火热内迫，逆乘于肺，侵及中下二焦，故现腹中常鸣，气上冲腹，喘不能立，寒热，皮肤痛，目瞑，齿痛，顺肿，寒热如疟，少腹痛，腹胀大等。
辰戌之年：为太阳之气司天。太阳寒水之气主上半年之令。寒气淫胜，如戊癸化火之运，则水火相激，寒水伤心化热，则现痈疡，厥逆心痛，呕血、下血、衄血，善恐，眩晕欲仆，胸腹满，手热，肘挛腋肿，心中儋儋大动，胸胁胃脘不适，面赤目黄，咽嗌干燥，甚至面黑如始，渴欲饮水等。其下半年，为太阴湿土之气在泉，土胜湿淫，土胜克水，故其病在脾、肾、三焦、膀胱等，表现为饮邪积聚、心痛、耳聋浑浑熔焊、嗌肿喉痹，阴病见血如便血、溺血，少腹肿痛、小便不痛等，头痛、目痛如脱、项部掣痛、腰痛不可回转、胭如结、喘如别等。
巳亥之年：为厥阴之气司天。厥阴风木之气主上半年之令，风气淫胜，木邪乘土，故其；病为风木克脾，土不胜木。表现为胃脘心部疼痛，连及两胁，鬲咽不通，饮食不下，舌本强，食人则呕，冷泄腹胀，便溏泄瘕，小便不通等。其下半年，为少阳相火之气在泉，相火；淫胜，热极生寒，寒热更至，热在下焦则注泄赤白，少腹痛，溺赤，甚则血便。其余诸病与，少阴在泉同候。医学教育网搜集整理
综上所述，司天在泉不同，六气变化各异，引起人体脏腑发病也不尽一致。但其发病规律都是用五行生克制化理论来加以说明的。如少阴君火司天，则火灼肺金，多见肺病；阳明燥金在泉，燥气太过，则金气克木，故肝病居多等。此外，六气有胜复之别，对人体脏腑发病的影响也不相同，其规律也是根据五行生克制化理论来制定的。六气盛衰不常，有所胜则必有所复。如，厥阴风木之气太过，木可胜土，土受其制，由于五行相制，金可克木，因此，土气被克过甚的情况下，；金气变成为复气而产生异常。所以，我们不但要考虑到肝病、脾胃病，同时也要考虑到肺病。故曰：“厥阴之胜，此言风木气胜而土受制也……厥阴之复，此言木气先金制而既乃复也”（《世补斋医书》）。
3.客主加临与发病
客主之气彼此是相生的，便相得而安和，气候正常不致为病。如果彼此是相克的，便不相得而为害，气候异常而致病。所谓 “气相得则和，不相得则病”（《素问·五运行大论》）。
由于客主加临的顺逆，也可使疾病有轻重缓急之不同。逆则病情深重，传变迅速，危害甚大；顺则病情轻浅，其势亦缓，其危亦微。故曰：“君位臣则顺，臣位君则逆，逆则其病近，其害速，顺则其病远，其害微”（《素问·六微旨大论》）。
4.运气同化与发病
运气同化，因邪气有轻重，故发病亦有轻重缓急之不同。天符和太乙天符之年，气候专一。易形成太过之气为病；岁会之年，气候多和平？听以天符之年容易发生危重的急性病；太乙天符之年容易出现死亡率极高的暴发性疾病；岁会之年罹病后，多病情轻而病势缓。所以说：“天符为执法，岁会为行令，太乙天符为贵人”。邪之中人奈何，……中执法者，其病速而危；中行令者，其病徐而持；中贵人者，其病暴而死“（《素问·六微旨大论》）。”执隐者位于上，犹执政也。行令者位乎下，犹诸司也。贵人者，统乎上下，犹君主也。……中执法者，犯司天之气也。天者生之本，故其病速而危。中行令者，犯地支之气也，害稍次之，故其病徐而持。持者，邪正相持而吉凶相半也。中贵人者，天地之气皆犯矣，故暴而死“（《类经。运气类》）。
综上所述，我们可以根据运气学说来推测每年气候变化和疾病发生的大致情况。其具体推算方法是：其一，根据每年的主运主气变化的规律来推测气候变化和发病规律。每年气候变化的一般规律是春风、夏热、长夏湿、秋燥、冬寒。其发病情况是：春季多肝病，夏季多心病，长夏多脾病，秋季多肺病，冬季多肾病。其二，根据该年的天干确定中运之气，根据地支确定司天在泉之气和客主加临，再找出该年干支的制约关系来确定大运之太过不及和运气同化，最后对上述诸方面进行综合分析，并根据五运和六气的特点来推算出该年的大致发病规律。如庚申年，大运之气为金运太过。
少阳相火司天，厥阴风木在泉。六气的客主加临，一步为主气厥阴风木，客气少阴君火；二步为主气少阴君火，客气太阴湿土；四步为主气太阴湿土，客气阳明燥金；五步为主气阳明燥金，客气太阳寒水；六步为主气太阳寒水，客气厥阴风木。这五步均为客主相生为相得，但因主生客故为逆。第三步为主气少阳相火，客气少阳相火，是客主同气为顺。庚申年值年大运虽为金运太过，但司天之气少阳相火克大运之金气，故为平气之年。综合分析可知：庚申年为平气之年，气候正常或轻微变化，是年不致有大病流行。上半年虽为少阳相火司天，但三步客主加临是客生主，为相得为顺，故气候亦属正常不致为病。下半年为厥阴风木在泉，兼之五六步为主生客为逆，可能出现风淫为病，罹病之后病情较重，病势发展较快。但是，其年运为平气，所以不会造成疾病大流行。
