①慢性细菌性痢疾：
常有急性菌痢病史，粪便培养可分离出痢疾杆菌，结肠镜检查时取粘液脓性分泌物培养的阳性率较高，抗菌药物治疗有效。
②慢性阿米巴痢疾：
病变主要侵犯右侧结肠，也可以累及左侧结肠，结肠溃疡较深，边缘潜行，溃疡间的粘膜多属正常。粪便检查可找到溶组织内阿米巴滋养体或包囊，通过结肠镜取溃疡渗出物作肠检更易找到阿米巴滋养体。抗阿米巴治疗有效。
③克隆病：
鉴别要点见表1
|
表1溃疡性结肠炎和克隆病的鉴别 |
| |
溃疡性结肠炎 |
克隆病 |
| 症状与体征 |
发热 |
较少见 |
常见 |
| |
腹痛 |
较轻、常在左下或下腹 |
较重、常在右下或脐周 |
| |
腹块 |
罕见 |
常见 |
| |
粪便 |
常有粘液、脓血 |
一般无粘液脓血 |
| |
里急后重 |
常见 |
少见 |
| |
中毒性巨结肠 |
可有 |
少见 |
| X线检查发现 |
受累肠段 |
以直肠、乙状结肠为主，可向上扩展，结肠病变连续性，偶有回肠末段受累 |
以回肠末段与相邻结肠为主，节段性受累 |
| |
肠腔狭窄 |
较少见 |
多见 |
| |
瘘管形成 |
少见 |
多见 |
| 直肠结肠镜发现 |
部位 |
常见直肠乙状结肠病变 |
可见近段结肠病变，少数累及直肠 |
| |
正常粘膜 |
病变弥漫，无正常粘膜 |
见于肠段病变之间 |
| |
粘膜病变 |
细颗粒状，有糜烂与浅溃疡 |
卵石样，有沟槽样溃疡 |
| |
粘膜脆性 |
增加，触之易出血 |
一般不增加 |
| |
炎性息肉 |
常见 |
可见 |
| 活检病理发现 |
肠壁炎症 |
主要在粘膜与粘膜下层 |
全壁性 |
| |
肠腺隐窝脓肿 |
多见 |
少见 |
| |
非干酪性肉芽肿 |
无 |
多见 |
| 癌变 |
|
可见 |
少见 |
④结肠癌：
多见于中年以上，常经直肠指检查可触及肿块，结肠镜与X线钡剂灌肠检查对鉴别诊断有价值，须注意与溃疡性结肠炎引起的结肠癌变区别。
⑤血吸虫病：
有疫水接触史，常有肝脾肿大，粪便检查可发现血吸虫卵，孵化毛蚴阳性，直肠镜检查在急性期可见粘膜黄褐色颗粒，活检粘膜压片或组织病理检查发现血吸虫卵。
⑥肠易激综合症：
伴有全身神经官能症，粪便有粘液但无脓血，显微镜检仅见少数白细胞，结肠镜检查无器质性病变证据。
⑦其他：
肠结核、缺血性结肠炎、伪膜性肠炎、难辨梭菌性肠炎、放射性肠炎、结肠息肉病、结肠憩室炎等应和本病相鉴别。
