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常规切片中，肌上皮细胞难以辨认。若新鲜腺组织经过锇酸处理，则肌上皮细胞清晰可见。其胞浆内含有活性很强的ATP酶和碱性磷酸酶。故针对此酶的组织化学染色可见肌上皮细胞的典型形态。光镜下，细胞体小，形态扁平，发出4——8支分支状突起，该突起呈放射状包绕着腺泡表面，形似篮子，故又称篮细胞。其胞核较大呈扁圆形，几乎占据整个细胞。电镜下，仅见散在分布的线粒体与粗面内质网，高尔基复合体通常位于核周部分，微吞噬小泡位于胞浆膜内侧，有时可见脂滴。在细胞突起内充满着纵形排列的细丝，直径约6——10nm，常聚合成致密小体，此结构与平滑肌细胞相类似称肌微丝 。

免疫荧光、免疫组织化学研究证实肌上皮细胞内含肌动蛋白和肌球蛋白，刺激肌上皮细胞胞可使导管内压力发生变化等，均提示肌上皮细胞有收缩功能，协助腺泡或导管排出分泌物。又因该细胞位于腺上皮细胞与基膜之间，借桥粒与腺上皮细胞相连接，细胞内含角蛋白等上皮细胞的特征性结构与免疫组织化学反应，提示其可能为上皮性来源。有学者认为涎腺肌上皮细胞来自于原始多潜能涎腺导管细胞。

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