临床意义：
器官移植：HLA配型能改善移植物的存活率。供体和受体的HLA-A，B。DR完全相同者的存活率显然高于不同者。在尸肾移植中，HLA-DR配型效果更甚于HLA-A，B配型。HLA配型的作用可以归钠为：①在肾移植中，供受双方共有的DR抗原越多，或已检查出的DR错配抗原数越少，移植存活率就越高；②在移植前输血的患者中，DR配型能提高存活率；③骨髓移植前不宜输血，以防止受体被免疫。且因经过射线或药物处理，供受双方HLA型相合比ABO血型相合更为重要。
其它如心、肝、肺等器官的移植，多用于生命垂危的患者，脏器来源稀少，可供选掺的器官有限，实际很难达到HLA配型相同，主要要求ABO血型相同。
自身骨髓移植虽不存在HLA配型问题，但只能用于白血病、肿瘤等，而不适用于原发性骨髓功能不全的疾病，如再生性障碍性贫血等。
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