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病原治疗同另两种衣原体感染,对四环素类、红霉素及氟喹诺酮类药物均极敏感,对磺胺耐药,故常用四环素或红霉素,2g/d,分4次口服。亦可用多西环素(doxycyc1ine)0.1g/次,2次/d,疗程>3周。孕妇、哺乳期妇女及儿童禁用四环素和喹诺酮类药物。儿童(包括婴幼儿)可用克拉霉素(克拉红霉素),有较好的疗效。部分病例停药后可复发,尤其是用红霉素治疗者,再用四环素或多西环素治疗仍有效。近年来发现新型大环内酯类抗生素的阿奇霉素,在体外药敏试验对肺炎衣原体呈高敏反应,易进入细胞内,细胞内浓度是血浓度的200%,半衰期长,成人1g/次,1次/d,顿服,具高效和低胃肠道反应的优点。有报告认为阿奇霉素联合利福平是本病最佳治疗方法。另经多中心临床试验证实,对3~12岁儿童用克林霉素15mg/(kg.d)、红霉素50mg/(kg.d)或阿奇霉素10mg/(kg.d)均有效。
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