全草含多种生物碱：石松碱（lycopodine），尖叶石松碱（acrifoline），石松灵碱（lycodoline），伪卷柏石松碱（pseudoselagine），αβ-玉柏碱（α、β-obscurine），卷柏石松碱（selagine）即石杉碱（huperzine）A，石松岩定碱（lycodine），6β-羟基石杉碱（6β-hydrocyhuperzine）A。还含卷柏石松素（selagin），香草酸（vanillic acid）及阿魏酸（ferulic acid）。
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