朱晓琴等认为鹅掌楸种群大多处于不利的生境，但仍具有较高水平遗传多样性，对一个具有复杂遗传结构的濒危物种的保护应采取综合措施。首先要制止乱砍乱伐，努力保存现有的居群和个体，在原地保护基础上，创造一个较适宜的生境。还可认为迁地创造大居群、大空间，给该物种提供基因交流和重组条件，组织目前各孤立小居群由于遗传漂变以及近亲交配而引起的遗传多样性降低。王章荣还认为中国鹅掌楸基因资源的保护应以迁地保存为主，建议在中国的华东，中南和西南选择适宜地点，分别建立基因库，保存中国现有自然资源，同时选择优良种群，人为促进天然更新措施，进行就地保存。还应开展种群间的交配，促进基因交流，拓宽该树种的遗传基础。

早在20世纪30年代就有北美鹅掌楸引种栽植在中国的南京、昆明、青岛、庐山、杭州、上海等地，但数量极少。1991年鹅掌楸作为世行贷款国家造林项目阔叶树课题的主要树种，中国首次有规模引种多个北美鹅掌楸南部种源，并开展了全分布区的地理种源试验。根据李健民等报道，北美鹅掌楸种源在福建邵武试验点试验结果，北美鹅掌楸根系不发达，人工造林成活率和保存率都不高，造林后植株死亡率都高于中国鹅掌楸，大面积造林总是难以成功。他们认为引种北美鹅掌楸的目的在于丰富种间杂交育种资源，而不在于丰富该地区的造林树种，在引种5个北美鹅掌楸参试种源中，来自较内陆的密苏里种源表现最好，可用作种间杂交育种的亲本种群。