保护价值秦艽及麻花艽在国家重点保护的药用植物物种中列为国家三级重点保护植物，其保护价值主要是：
① 秦艽为常用中药，不仅中药中用，在藏药、蒙药中也是常用药，实用性强，是具有重要药用价值的有限自然资源
②生长周期长，数量少，不仅现存野生植株数量较少，而且由于人类“竭泽而渔”地掠夺式采挖利用，资源仍在继续减少，供求矛盾较突出
③ 有重要科学研究和遗传储存价值，秦艽及麻花艽在区系成分上为我国的优良品种，对其保护具有重要的遗传储存价值。
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