性状鉴别：红曲呈长卵形、类椭圆柱形或不规则形，略扁，长5-8mm，宽2-3.5mm，厚1.5-3mm。表面紫红色或棕红色，凹凸不平，有的具浅纵、横纹理。质脆，易沿横纹理断开，断面平齐，边缘红色至暗红色，中部略凹，白色至浅红色。气特异，味淡、微甘，以红透质酥、陈久为佳。
显微鉴别：粉末特征：淡红色。菌丝有隔、多核，有分枝，紫红色。枝端可见单个或成串的分生孢子；分生孢子球形、椭圆形或梨形，褐色，(9-11)μm×(6-9)μm。枝端还可见单个类球形的橙红色子囊壳(闭囊壳)，内有多数子囊，子囊内含8个子囊孢子；子囊孢子卵圆形或近球形，光滑，无色或淡红色，(5-6.5)μm×(3。5-5)μm。
