卡尔·林奈最初将欧洲百合的学名描述为LiliumMartagonmontanummajus,floribusreflexis,最初是于1477年用英语记录。其种加词martagon的起源有多种说法。一种语源是名称源自奥斯曼帝国的苏丹穆罕默德一世(1413年-1421在位)佩戴的一种土耳其头巾martagan,是一种新式的伊斯兰包头巾,因为其花瓣反卷,与这种头巾类似。另一语源是名称来自战神玛尔斯的名字Mars(属格martis),因为炼金术士认为欧洲百合的形态与金属的状态变化不无关系。欧洲百合的英语俗名Martagon或Turk'scaplily都与第一种语源有关,而其德语俗名Türkenbund也是外来语,源自土耳其头巾turban。