该科植物有些种类入药，如血水草、荷青花、白屈菜、博落回、多种绿绒蒿、角茴香、紫金龙、荷包牡丹、多种紫堇，尤其紫堇属中的延胡索类，为著名的中药材，罂粟为鸦片的原植物，富含吗啡、可待因等，中药名为罂粟壳。
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