现代概念认为，高括约肌张力诱发肛管后中线供血不良是原发性肛裂的病因。肛裂的本质是缺血性溃疡，其科学根据概括如下：

一解剖学因素：肛门外括约肌浅部，从尾骨起，向前至肛门后方。肛门前、后方不如两侧牢固，容易受损伤。因此，肛门后部受粪便压迫较重，又因肛管后部血液循环不足，弹性较差，肛门腺分布又较多，这些都是发生肛裂的因素。

二外伤学说：干硬的粪便或异物容易引起肛管皮肤的损伤，这是引起肛裂的主要因素。

三感染学说：主要是肛门后部的肛隐窝感染，炎症向肛管皮下部蔓延，致使皮下脓肿破溃而成肛裂。

四内括约肌痉挛学说：由于肛管部位损伤或炎症刺激，使肛门括约肌处于痉挛状态，致使肛管张力增强，易损伤成肛裂。

五肛门狭小学说：肛管皮肤在发育中迟缓，生成肛管狭小，易损伤成肛裂。

六继发因素：静脉曲张外痔、肛乳头肥大等，其病灶边缘往往可见有肛裂，可能的原因是排便时粪便对局部病灶挤压伤及病灶以外的组织，从而在病灶的侧缘形成肛裂。

七性别因素：肛裂好发于妇女，可能的原因有：

1妇女相对较男性挑食，大便没有规律，多数有便秘病史。

2月经期没有很好休息和注意经期卫生，引起肛门局部炎症，导致肛裂。

3妊娠：妇女妊娠后活动相应减少，肠蠕动减弱，极易产生便秘，干硬的粪块易擦伤肛管皮肤引起局部感染，导致肛裂。

4在分娩时常常因用力过度，容易撕裂肛管会阴部位，引起疼痛和出血，产生肛裂。

5分娩之后长期卧床休息，很少活动、肠蠕动减慢，同时怀孕时腹壁扩张，产后腹壁松弛无力、腹压降低，这都会使肠内容物在肠腔内停滞，难以排出；产后饮食欠当，过食精细食物，不吃或很少吃蔬菜、水果等富含纤维的食物，有些人饮水少，诱发、加重便秘，导致肛裂。

八便秘因素：便秘患者，大便干燥，排便费力，由于用力排便等造成肛裂。

九不良排便习惯：

1蹲位看报：上厕所时，有很大一部分人都喜欢下蹲位看书看报，造成下蹲和排便时间延长，容易造成肛门直肠内瘀血而诱发肛裂。

2排便过度用力：一些人不管便意（排便感觉）是否强烈，盲目不停地猛力努挣，使直肠肛门和盆底肌肉增加不必要的负担与局部瘀血，导致肛裂的发生和发展。

十吸烟：平时和排便时吸烟能缓冲大脑的排便反射，极容易造成便秘，间接形成肛裂。