森田疗法主要的适应症是所谓“神经质”。大致包括当今分类中的焦虑症、恐怖症、强迫症、疑病症、神经症性睡眠障碍等。

森田认为发生神经质的人都有疑病素质。他们对身体和心理方面的不适极为敏感。而过敏的感觉又会促使进一步注意体验某种感觉。这样一来，感觉和注意就出现一种交互作用。森田称这一现象为“精神交互作用”，认为它是神经质产生的基本机制。

森田疗法的基本治疗原则就是“顺其自然”。顺其自然就是接受和服从事物运行的客观法则，它能最终打破神经质病人的精神交互作用。而要做到顺其自然就要求病人在这一态度的指导下正视消极体验，接受各种症状的出现，把心思放在应该去做的事情上。这样，病人心里的动机冲突就排除了，他的痛苦就减轻了。

该疗法分门诊治疗和住院治疗两种。症状较轻的可让当事人阅读森田疗法的自助读物，坚持日记，并定期到门诊接受医生的指导；症状较重的则需住院。住院生活分四个时期：一，绝对卧床期，四天到一星期。禁止病人做任何的事情，病人会有无聊的感觉，总想做点什么。二，轻微工作期，三天到一周。此间除可轻微劳动外仍然不能做其他事情，但开始让病人写日记。三，普通工作期，三天到一周。病人可开始读书，让他努力去工作，以体验全心投入工作以及完成工作后的喜悦。四，生活训练期，一到两周。为出院准备期，病人可进入一些复杂的实际生活。

森田疗法出现本世纪早期，比当今流行的大多数欧美体系早很多年，它不仅在日本医学、心理学独树一帜，且影响远播，成为有世界影响的一个治疗体系。他的一些基本理念，特别是顺其自然的治疗原则，表现出浓厚的东方文化色彩。这是源于东方文化，比较适合于东方文化中的人。

目前，森田疗法这种根源于东方文化背景和传统思想的心理疗法不仅风行于日本，而且也受到欧美学者的关注。雷诺氏（David Reynolds）将森田疗法介绍到美国，并应用于神经症的治疗中。1983年日本森田疗法学会正式成立，第一任会长高良武久教授及第二任会长大原健上郎教授继承并发展了森田疗法，并将森田疗法的适应症扩大到神经质以外的神经症、精神病、人格障碍、酒精兹物依赖等治疗领域。并且已广泛应用于正常人的生活适应及改善生活质量中。国际森田疗法学会于1991年成立。在我国，1992年召开了首届森田疗法研讨会。1994年4月底，第三届国际森田疗法大会在北京国际会议中心召开，来自世界14个国家的300多名代表就森田疗法的研究及应用进行了广泛而深入的学术交流。