1、原料方面。由于生态环境日益恶化和过度开发，许多野生中药材资源已经不能满足需求，甚至濒临灭绝，如野生人参、天麻、三七、冬虫夏草、虎、豹、麝、熊等。而人工种植的中药材由于药农缺乏药学知识，随意使用化肥，不进行适时采收及合适的产地加工，出现种质混杂、品种退化，重金属、农药残留超标等质量问题。此外，不适当的引种也使许多药材不具备地道性，如牛膝和野牛膝、白芷和大活等医学`教育网搜集整理。

2、加工炮制方面中药炮制是我国独有的传统制药技术，中药饮片是中药材的炮制加工品，其质量好坏直接关系到人民用药的安全与疗效。目前全国饮片切制或炮制规程还没有完全统一的标准通则可依。如切制的中药饮片规格片类、丝类、段类及各种用辅料炮制炒制的标准工艺，即使现在已有规定标准也是参差不等，存在较大差异，使饮片在临床应用的疗效受到很大的影响。

3、中药饮片形式传统饮片系指目前国家和地方标准中收载的，能直观鉴别出品种的饮片。其不足之处为配方时剂量欠准确，用量大且需煎煮，饮片厚大，有效成分煎出率低，包装简陋，容易串味，质量影响因素多，本身及环境卫生差，配方工作强度大、速度慢、出错率高及难以自动化调剂等。

4、中药饮片生产企业中药饮片产业基础差，技术改造起步晚，是中药各产业中最薄弱的环节，整体产业水平还很低，表现在生产企业多，规模小，效益低，技术开发和创新能力弱，生产工艺和设备落后，管理不规范等问题。绝大多数中药饮片生产企业是作坊式的加工点，生产条件简陋，生产、质量检测设备落后，企业的现代经营管理经验及专业技术人才缺乏，以致药材的有效成分流失，饮片质量难以保证。

5、中药饮片包装包装是商品储存、运输、流通中保证商品质量，使其不受污染的手段。而传统饮片包装简陋，主要为麻袋、草（蒲、席）包、布袋、化纤袋，容易串味，鲜有内包装、说明及批号，缺乏统一规格。

6、中药饮片市场近年来，由于缺乏质量监督手段和市场管理不严，中药饮片市场规范程度一直很低，以次充好、以假乱真、价格欺诈现象时有发生，如以“参薯”充“山药”，以“党参子”充“车前子”，以“虎刺”充“巴戟天”等。

7、中药饮片调配方式中药调配自宋代以来，一直以戥秤逐一称量调配为主，这种调配作业方式在一定历史条件下应该说是可行的，是有历史功绩的。但随着社会的进步，其弊端已逐步显现出来，如工作人员站立作业，往返频繁走动，劳动负荷重；药物散包存放，在群体作业过程中造成空气污染严重，室内“脏、乱、差”的现象较常见，药剂人员的形象和药剂工作应有的学术氛围均受到破坏，使药剂人员的身心健康长时间受到损害。同时，分剂量不准，药物混包后难以查对，药物错、漏难以发现和纠正，且调配操作和病人候药时间长，占用人力过多。

8、人力资源方面尽管中药饮片的传统优势在中国，但中国科技队伍力量薄弱，人才外流严重，炮制专业人员更少，甚至面临后继乏人的局面。新技术、新方法的引入如生物技术、信息技术等现代高新技术在中药饮片科技中尚未引起足够的重视，从业人员不多。