体外药敏实验根据折点决定的耐药和敏感，并不能完全代表细菌在体内对抗菌药物耐药和敏感。抗菌药物对某种细菌敏感还是耐药，决定于抗菌药物的作用机制和细菌的基因型，耐药基因的检出可以直接预告耐药，但由于许多细菌的耐药涉及许多的机制，其原因也没有完全阐明，监测耐药的分子生物学方法相对于体外药敏试验更需要复杂的设备和仪器。
因此，目前临床微生物实验室主要还是通过体外药敏试验来预测细菌耐药。由于体外药敏结果是决定于基因型的表型，细菌在体外对抗菌药物耐药，体内必定耐药，而在体外敏感的，体内就不一定敏感。除非体外药敏的技术因素，耐药的结果可以确信，抗生素敏感试验改为抗生素耐药试验更为恰当。
简而言之，体外试验的敏感表明推荐的抗菌药物可以使用，可能达到临床效果；中介，意味着这个范围的抗菌药物在常规剂量下疗效不理想，高浓度下可能有效；耐药，意味着此种情况下抗菌药物不能用于此菌株的治疗。
