硒在人体内经胃肠、呼吸道粘膜和皮肤吸收，硒酸盐、硒代蛋氨酸中硒的吸收优于亚硒酸钠，吸收率分别为92～94%，75～97%和48～60%，硒吸收后通过血浆运载，主要由血浆中的蛋白等运送到全身各组织，人类不存在吸收的平衡机制，故安全范围较窄。
硒在体内的含量分布，以肾含量最高，依次为肝、脾、胰、睾丸、心肌、肠、肺、肌肉、脑，肌肉组织中硒虽然较低，但在总体硒中所占比例最高。
硒的排泄，主要由尿液和粪便排出，其排出速度与硒的化学形式有关，硒代蛋氨酸经尿和粪便中排泄少而易贮留于体内，此外硒还可在体内转成甲基硒化物由肺呼出，经汗液、唾液排泄量很少。
用金膜电极微分阳极溶出伏安法测定了硒酵母在兔体内的药物动力学参数，实验结果表明，硒酵母较亚硒酸钠具有生物利用度高、维持时间长和峰浓度高的特点，是优于亚硒酸钠的补硒剂。
中国地方病研究中心大骨节病研究所对硒酵母片进行了人体生物利用度试验，结果表明硒酵母的相对生物利用度高于亚硒酸钠，吸收较亚硒酸钠慢，但吸收完全，药时曲线下面积大于亚硒酸钠，体内驻留时间也较亚硒酸长。
