肺结核的临床与X线表现与多种非结核疾病相似，容易误诊，痰菌阳性者容易诊断，但需通过菌种鉴定除外非结核分枝杆菌肺病，痰菌阴性者需除外肺癌、肺炎、肺脓肿、支气管扩张等疾病。
肺癌 肺癌多见于中老年，吸烟史多见，常无明显的结核中毒症状，多有刺激性咳嗽，胸痛，进行性消瘦，X线上结核病灶多有卫星灶及钙化，肺癌病灶边缘常有切迹、毛刺，胸部CT有助于二者鉴别，必要时可做纤维支气管镜及肺活检，临床上难以排除肺癌者必要时可考虑剖胸探查。
肺炎 病情进展较快的继发性肺结核形成干酪性肺炎易误诊为肺炎球菌所致的大叶性肺炎，肺炎多起病急骤、高热、寒战、胸痛伴铁锈色痰，X线病变常局限于单个肺叶，抗生素治疗有效。干酪性肺炎多有结核中毒症状，起病慢，黄色粘液痰，X线病变多位于右上叶，可累及多叶、多段，密度不均，可出现虫蚀样空洞，抗结核治疗有效。
肺脓肿 肺脓肿的空洞多见肺下叶，脓肿周围的炎症浸润较严重，空洞内常有液平，肺结核空洞以上叶多见，洞内较少有液平。此外肺脓肿起病急骤，高热，大量脓痰，痰中无结核菌，血白细胞总数及中性粒细胞显著增多，抗生素治疗有效。
