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真菌不能自行制造养分（某些真菌会捕食其他生物，其他生物如线虫），因而无法独自于自然界生存，必须与别种生物借由寄生、腐生或者共生方式来吸取生活需要的营养。它主要依靠营养菌丝（酵母菌除外）来吸收营养物质。真菌还可以从分化岩石中吸收微量元素。