（一）在医学中的应用

　　1.细菌的鉴定和研究：对细菌进行鉴定，研究其形态、生理、抗原结构、致病性、遗传与变异等生物学性状，均需人工培养细菌才能实现。

　　2.细菌性疾病的诊断和治疗：细菌感染引起的疾病，常须从患者体内分离出病原菌才能确诊。同时对分离出的病原菌作药物敏感试验，帮助临床选择有效的药物进行治疗。

　　3.生物制品的制备：人工分离培养所得的纯种细菌及其代谢产物，可制成疫苗、类毒素、诊断用标准菌液，或经类毒素、纯种细菌免疫动物后制备抗毒素及诊断血清，用于传染性疾病的诊断、预防与治疗。

　　4.细菌毒力分析及细菌学指标的检测：人工培养细菌后，再用免疫学和其他方法检测细菌的毒力因子，并配合动物实验来鉴定细菌的侵袭力和进行毒力分析；也可通过定量培养计数等，对饮水、食品等的微生物学卫生指标进行检测。

　　（二）其他方面的应用

　　1.在工农业生产中的应用：利用细菌的培养和发酵，可提纯精制出抗生素、维生素、氨基酸、醇类、味精等产品，还可用于石油脱蜡、污水处理、制造菌肥等。

　　2.在基因工程中的应用：由于细菌繁殖快，容易培养，故常用细菌作为基因受体细胞。如将人或动物细胞中编码胰岛素的基因重组到质粒上，再导入大肠埃希菌，就能从大肠埃希菌的培养液中获得大量基因工程胰岛素。基因工程制造干扰素、乙型肝炎疫苗等都已成功。