大疱性类天疱疮是侵犯基底膜带的一种自身免疫性疾病，基底膜带是免疫球蛋白及补体沉着的部位；也是循环自身抗体（抗基底膜抗体）发生反应的部位。由于嗜酸性粒细胞在病损的早期即已出现，因此，认为嗜酸性粒细胞在基底膜区的损伤、局部水疱形成，在上皮-结缔组织界面分离中起重要作用。

　　早期的研究发现，大疱性类天疱疮可能与HLA-DR5相关；但新近的分子流行病学研究提示医学教|育网搜集整理，尚无证据充分证明大疱性类天疱疮与任何HLA位点相关。但免疫印迹及免疫沉淀技术已证实大疱性类天疱疮抗原（BPAg）的两个成分：主要抗原230～240kD BPAg（BPAg1），80%～90%的患者血清中存在有循环抗BPAgl抗体；次要抗原l60～180kD BPAg2，50%的大疱性类天疱疮患者血清中有抗BPAg2的抗体；有关这两个抗原成分均已分子克隆并已明确其染色体定位。免疫电镜和分子克隆的技术证实，两个抗原成分均是跨膜蛋白质，由鳞状上皮的基底细胞分泌，已分化的角朊细胞则不合成这两种抗原成分。功能研究证实，这两个抗原成分作为表皮基底膜带的独立成分，中介上皮与其下方的结缔组织的联系，同时又是自身免疫性疾病的靶抗原，在大疱性类天疱疮的发病中起关键作用。对细胞因子的研究发现，γ-干扰素可以在蛋白质及mRNA水平对230kD的类天疱疮抗原进行转录前调控，而这种调控对γ-干扰素有时间及剂量依赖性。IL-1β、IL-5、IL-6的血液浓度、疱液浓度与病情严重性具有相关性，可作为监控疾病的参考指标。

　　抗基底膜带自身抗体主要为IgG，并且主要为IgG4或IgA亚类，约有25%的病例IgM与IgA共同出现或单独出现。