牙本质中的无机物约占重量70%；有机物为20%，水为10%.无机物中主要为磷灰石晶体，其晶体比釉质中的小。有机物中胶原蛋医学教育|网搜集整理白约占18%，主要为Ⅰ型胶原，此外还有牙本质涎磷蛋白、牙本质基质蛋白以及氨基多糖等。
牙本质因其较高的有机物含量及牙本质小管内水分的存在而具有一定的弹性，因而给硬而易碎的釉质提供了一个良好的缓冲环境。由于牙本质结构的多孔性，因而具有良好的渗透能力。
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