包虫病可在人体内数年至数十年不等。临床表现视其寄生部位、囊肿大小以及有无并发症而异。因寄生虫的虫种不同，临床上可表现为囊型包虫病（单房型包虫病）、泡型包虫病（多房型包虫病）、混合型包虫病。

1.肝包虫病囊肝包炎极度肿大时右上腹出现包块，患者有饱胀牵涉感并可有压迫症状。囊肿大多位于右叶，且多位于表面，位于左叶者仅占1/4.囊肿位于右叶中心部时肝脏呈弥漫性肿大，向上发展压迫胸腔可引起反应性胸腔积液、肺不张等；向下向前发展则向腹腔膨出。大多数患者体检时发现肝脏极度肿大，局部有表面平滑囊肿感。少数病例叩击囊肿后可听到震颤。由细粒棘球蚴所致的通常称为单房型包虫病；由多属棘球蚴所致的称为多房型包虫病，简称泡球蚴病。包虫增殖方式呈浸润性，酷似恶性肿瘤。肝泡球蚴尚可通过淋巴或血路转移，继发肺、脑泡型包虫病，故有恶性包虫病之称。肝质地变硬，表面不平。

2.肺包虫病常有干咳、咯血等症状。约有2/3患者病变位于右肺，且以下叶居多。囊肿破入胸腔时可发生严重液气胸。约半数患者的囊肿破入支气管，随着囊液咳出而自愈，偶可因囊液大量溢出而引起窒息医学/教育网。

3.脑包虫病发病率低（1%～2%），多见于儿童，以顶叶最常见，临床表现为癫痫发作与颅内压增高症状。包囊多为单个，多数位于皮层下，病变广泛者，可累及侧脑室，并可压迫、侵蚀颅骨，出现颅骨隆凸。

4.骨骼包虫病。国内报告远低于国外，仅占0.2%左右。以骨盆和脊椎发生率最高，其次可以四肢长骨、颅骨、肩胛骨、肋骨等。细粒棘球蚴侵入长骨后，感染通常从骨端开始疏松海绵骨首先受侵。由于骨皮质坚硬、骨髓腔狭小呈管状，限制包虫的发展，故病程进展缓慢，晚期可能出现病理性骨折、骨髓炎或肢体功能障碍。

5.其他心包、肾、脾、肌肉、胰腺等包虫病均比较少见，其症状似良性肿瘤。人感染包虫病后，常因少量抗原的吸收而致敏，如囊肿穿破或手术时，囊液溢出可致皮疹、发热、气急、腹痛、腹泻、昏厥、谵妄、昏迷等过敏反应，重者可死于过敏性休克。