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徐州医学院药学院由 1997年学校开办的江苏省首家临床药学专业方向发展而来,2001年成立临床药学系,2005年更名为药学系,2008年正式更名为药学院。现拥有药学、临床药学、药物制剂3个本科专业,已培养药学类专业人才1000余人。2008年,药学本科专业成为国家特色专业建设点和江苏省特色专业。2012年,药学院的药学、临床药学、药物制剂3个本科专业组成的药学类专业获批成为江苏省“十二五”重点专业类。现有江苏省药学基础课实验教学示范中心和江苏省药学实践教育中心。2010年,药学一级学科获得硕士学位授予权,目前药理学、药物化学、药物分析学、药剂学和临床药学5个二级学科招收硕士研究生,同年,糖尿病并发症的药物防治成为江苏省优势学科生物学的主要研究方向之一。目前在校生1000余人。