非正当手段取得批准证明文件的处罚：
提供虚假的证明文件、申报资料、样品或者采取其他欺骗手段申请批准证明文件的，法律责任包括：
1.省、自治区、直辖市（食品）药品监督管理部门对该申请不予受理，对申请人给予警告，医学|教育|网搜集整理一年内不受理其申请；
2.已取得批准证明文件的，撤销其批准证明文件，五年内不受理其申请，并处一万元以上三万元以下罚款。
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