中医儿科学中，认为小儿便秘主要与大肠和肺的功能失调有关，但更深层次的根源往往涉及到脾和肾。在中医理论里，大肠主传导糟粕，若大肠功能失常，则会导致排便困难、粪便干结等症状。同时，肺与大肠相表里，在生理上相互影响，肺气不宣或者肃降不利也会影响大肠的正常运化。
此外，脾为后天之本，负责运化水谷精微，若脾虚则不能很好地吸收和转化食物中的营养物质，导致肠道津液不足而引发便秘。肾藏精，主生长发育及生殖机能，在小儿生长过程中起着至关重要的作用。如果肾阴不足或肾阳虚弱，则可能影响到整个消化系统的功能状态，从而间接引起便秘现象。
因此，在治疗小儿便秘时，中医通常会根据具体病因采取相应的调理方法，如健脾益气、滋补肝肾等，并结合饮食指导和生活习惯调整来达到标本兼治的效果。
